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김승철 교수님(Seung-Chul Kim)

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작성일 21-04-27 17:25

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 김승철 (Kim, Seung-Chul)

 직함

 교수 (Professor)

 전공

 식물계통학 (Plant Systematics)

 연구실

 식물분자계통분류학 연구실 (Plant Molecular Phylogenetics Laboratory)

 전화

 031-299-4499

 사무실

 제2과학관 32105

 홈페이지   https://sites.google.com/view/haeun-skku/ 

 이메일

 sonchus96@skku.edu or sonchus2009@gmail.com

 연구실 소개 

연구실 개요 및 역사: 성균관대학교 식물분자계통분류학 연구실은 한국 식물분류학계에서 가장 긴 역사와 전통을 가지고 있습니다. 본 연구실은 학과가 창설된 다음 해인 1954년, 한국 식물분류학계의 선각자이신 하은 (霞隱) 정태현 교수님이 부임하시면서 출범하였습니다. 성균관대학교 재직 당시에 필생의 업적 중 하나인 한국식물도감 초본 · 목본 (1956, 1957)을 집필하셨고, 1969년에는 ‘하은생물학상’ 재단을 설립하시어 매년 생물학계에 공헌한 후학들을 선정하여 시상하셨습니다. 그 후에 이상태 교수님이 1981년에 부임하시어 국내 최초로 화분학(Palynology)을 도입하셨고, 2010년 2월에 은퇴하실 때까지 국내외 학술지에 100여편의 논문, 10여종의 신종 발표, 및 여러 저서들을 출판하셨습니다. 약 30년간 성균관대학교에서 교수로 재직하시는 동안 후학들에게 화분학과 진화학에 많은 가르침을 주셨고, 현재는 성균관대학교 명예교수로 재직하심과 동시에 일반인들을 대상으로 활발한 강의활동을 펼치고 계십니다. 2009년 9월부터 현재의 김승철 교수가 부임하여 성균관대학교 분류학의 맥을 이어가고 있으며, 현재 1) 섬 (카나리 제도, 울릉도, 제주도 등) 식물의 기원과 진화, 2) 동북아시아 식물들의 계통학적, 계통지리학적, 집단 유전학적 연구, 그리고 3) 식물 종분화 메커니즘, 4) 외래침입 식물의 유전적 다양성 및 집단구조와 같은 연구를 여러 분자마커와 최신 분석 기법을 통해 다각도로 고찰하여, 식물이 겪는 다양한 현상과 관계에 대해 이해하는데 많은 노력을 기울이고 있습니다.

연구 분야: 본 연구실은 최신의 다양한 연구 방법을 사용하여 특정 식물 그룹 (예: 카나리 제도, 울릉도, 제주도의 섬 고유종, 동북아시아에 분포하는 주요 식물, 외래식물 등)의 기원과 진화적 메커니즘 그리고 계통학적 유연관계를 파악하는 연구를 수행하고 있습니다.  또한 희귀식물 보존, 외래 잡초성 분류군의 침입, 잡종화, 계통지리학 및 생물지리학과 같은 다양한 방식에서 연구를 진행 중입니다. 이와 같이 다양한 방식의 연구 방식과 분자 마커를 활용한 연구를 통해, 식물 다양성의 기전과 계통학적 양상을 밝히고 이해하는 것을 목표로 합니다.

응용 분야 또는 산물(product):식물 종들의 계통학적 관계와 진화 역사를 규명하는 계통분류학적 연구를 통해 화장품, 바이오 의약품 개발 분야에서 유용한 식물 후보종을 발굴하는데 높은 과학적 예견성을 갖도록 합니다. 또한 식물의 유전적 다양성, 구조 및 분화도를 파악하는 집단유전학적 연구를 통해 멸종 위기종들의 지속 가능한 보전 및 복원 전략을 수립하는데 기여합니다.

산학협력 사례 또는 취업 분야:본 연구실은 국립생물자원관, 국립수목원과 같은 국가 기관과의 공동 연구를 통해 식물종들의 진화, 다양성 및 계통학적 관계를 밝히는 연구를 활발히 수행하고 있습니다. 우리 연구실을 졸업한 학생들은 산림청 산하 공공기관인 국립수목원, 국립백두대간수목원, 환경부 산하기관인 국립호남권생물자원관, 그리고 국내 굴지의 화장품 회사인 아모레퍼시픽, 코스맥스 등의 기관에서 연구원으로 근무하고 있습니다.

연구실 홈페이지: https://sites.google.com/view/haeun-skku/

연구실 소개 영상: https://youtu.be/-piEw9E-HVQ 
 
 Reseach Background

The Plant Molecular Phylogenetics Laboratory at SKKU employs a variety of techniques to investigate evolutionary relationships, classification systems, speciation mechanisms, character evolution, and biogeography in flowering plants at various taxonomic levels. Specifically, we are interested in origin and evolution of endemic plants on oceanic islands (e.g., Jeju and Ulleung Island in Korea; The Canary Islands in Spain; The Juan Fernandez Islands in Chile). In addition, we conduct research on conservation genetics of rare plants, invasion of weedy species, homoploid and polyploidy hybrid speciation, phylogeography, and biogeography. We are determined to unravel the phylogenetic patterns and underlying processes generating plant diversity by utilizing diverse molecular markers and inter-bridging different disciplines and approaches.

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Evolution of Island Plants

카나리 제도, 울릉도 혹은 제주도와 같은 대양섬들은 식물들에게 새로운 생태적 지위를 제공하여 다양한 방식으로 식물의 진화가 일어나게 합니다. 유전자, 전사체, 혹은 유전체 수준에서의 진화계통학적 연구를 통해 이러한 섬 식물들의 고유하고 독특한 진화 역사 및 기작을 밝히고, 이들의 기원 및 대륙종과의 계통학적 유연관계를 파악하는 연구를 수행하고 있습니다.

 

Islands are natural laboratories where we can study evolution in vivo. In oceanic islands like the Canaries and the Juan Fernandez Islands, diverse ecological niches act as an important driving force in plant evolution. Using genetic, transcriptomic, and/or genomic research, our research examines evolutionary histories and mechanisms underlying plant evolution, as well as phylogenetic relationships between island and continental plants. In addition, we investigate the anagenetic speciation of plant endemics on Ulleung Island, Korea.

Phylogenetic Inference on Evolutionary History

식물 종들의 계통학적 관계와 진화 역사를 규명하는 계통분류학적 연구를 통해 다양한 식물 분류군에서 후속 연구를 이끌어내거나 유용 식물 자원 후보군을 발굴하는데 높은 과학적 예견성을 갖도록 합니다. 특히 동북아시아에 분포하는 주요 식물들의 계통학적 연구를 통해 한국과 그 주변 국가들에 분포하는 식물 종들의 연구 기반을 마련하고 있습니다. 계통지리학적 연구를 통한 종 분화 양상 및 대륙 간 불연속 분포 등에 대한 연구, 근연 분류군의 진화계통학적 연구를 통한 다양화 및 방산, 유전자 교류, 잡종화 등을 이해하는 연구 등을 수행하고 있습니다.

By studying the phylogenetic relationships and revealing evolutionary history of plant species, we can gain insight into further biological studies and discover new plant resources. We focus on plant species distributed in East Asia, including Korea and neighboring countries. Our team is currently working on phylogeographic studies to understand species divergence and inter-continental disjunction, as well as systematic studies on closely related species to better understand diversification and radiation, gene flow, and hybridizations.

Population Genetics for Conservation

집단유전학적 연구를 통해 유전적 다양성, 구조 및 분화도 등을 분석하여 식물 종들의 생태학적 고찰을 이끌어냅니다. 특히 고유종이나 멸종위기종과 같은 주요 식물들의 유전자원을 확보하고, 이들의 유전 및 집단 구조, 더 나아가 종으로서의 생태적 지위의 지속 가능한 보전 및 복원 전략을 수립하는데 기여합니다. 또는 생태를 교란하는 외래 침입종 집단의 유전 다양성을 파악하여 그 기원과 확산 정도를 이해함으로써, 이들의 확산을 방지하고 자연생태계를 유지하기 위한 기초 자료를 제공합니다.

 

Population genetics is the study of genetic variation within and among populations and the evolutionary factors that explain this variation. Population genetic study provides crucial information on the patterns of genetic diversity and population structure in endemic and highly threatened plant species. We carry out conservation genetic studies of threatened vascular plant species in the Red List of Korea, assessing their genetic diversity patterns and developing conservation strategies or management programs. As part of our invasive species management efforts, we also investigate invasive species in order to determine genetic diversity, geographic origins, and dispersal routes.

Plant Taxonomy & Floristic Research

관속식물의 분류, 기재, 동정, 명명을 통해 분류체계를 확립하여 계통진화연구에 대한 기초를 마련합니다. 계통진화연구 및 기타 후속연구를 위한 야생 유전자원의 확보 뿐만 아니라, 이에 우선하여 현장 조사 기반의 식물상 조사 및 식생 연구를 통해 자생 식물과 이들의 자연 서식지 환경 및 생태를 탐색하여 우리가 살아가는 자연환경의 생물다양성을 이해합니다. 종의 기재 및 발표, 분류군 형태조사, 식물상 조사, 자생지 조사 및 생태 조사 등을 통해 생물다양성 보존 및 생물자원 정보 확보에 힘쓰고 있습니다.

 

Classification, description, identification, and nomenclature form the basis of traditional taxonomic study and provide fundamental knowledge in pursuing future phylogenetic and evolutionary studies. Our team conducts floristic and vegetation studies to better understand the composition of plant species and their assemblages and biodiversity. We grasp essential knowledge on conservation of biodiversity and acquisition of biological resources/information via description of new and unrecorded species, morphological investigation, floristic study, and natural habitat and ecological studies.

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 Peer-reviewed Recent Publications (2018-present)

2023

1.    Kim, H.-B., Lee, D.-G., and Kim, S.-C. 2023. Plastomes of Sonchus (Asteraceae) endemic to the Atlantic Madeira archipelago: Genome structure, comparative analysis, and phylogenetic relationships. Plos one, 18(6), e0287523.

2.    Yang, J., Kim, S.-H., Gil, H.-Y., Choi, H.-J., and Kim, S.-C. 2023. New insights into the phylogenetic relationships among wild onions (Allium, Amaryllidaceae), with special emphasis on the subgenera Anguinum and Rhizirideum, as revealed by plastomes. Frontiers in Plant Science, 14, 1124277.

3.    Kim, Y., Kim, S.-H., Yang, J., Cho, M.-S., Koldaeva, M., Ito, T., Maki, M., and Kim, S.-C. 2023. Plastome-based backbone phylogeny of East Asian Phedimus (Subgenus Aizoon: Crassulaceae), with special emphasis on Korean endemics. Frontiers in Plant Science, 14, 1089165.

 

2022

1.    Yun, S., and Kim, S.-C. 2022. Comparative plastomes and phylogenetic analysis of seven Korean endemic Saussurea (Asteraceae). BMC Plant Biology, 22(1), 550.

2.    Kim, S.-C. 2022. Origin and evolution of endemic plants on Ulleung Island, Korea. Korean Journal of Biological Evolution, 1(1), 32-46.

3.    Sun, E.-M., Yun, S. A., Kim, S.-C., Chung, J.-M., and Im, H.-T. 2022. Saussurea namhaedoana (Compositae), a new species from Namhaedo Island, Korea. Korean Journal of Plant Taxonomy, 52(2), 97-101.

4.    Cho, M.-S., Yang, J., Mejías, J. A., and Kim, S.-C. 2022. Phylogenomic insight into dysploidy, speciation, and plastome evolution of a small Mediterranean genus Reichardia (Cichorieae; Asteraceae). Scientific Reports, 12(1), 11030.

5.    Yang, J., Kim, S.-H., Pak, J.-H., and Kim, S.-C. 2022. Infrageneric plastid genomes of Cotoneaster (Rosaceae): Implications for the plastome evolution and origin of C. wilsonii on Ulleung Island. Genes, 13(5), 728.

6.    Kim, S.-H., Shukhertei, A., Yang, J., and Kim, S.-C. 2022. Characterization of the complete chloroplast genome sequence of Potentilla gageodoensis (Rosaceae), endemic to the continental islands of Korea. Mitochondrial DNA Part B, 7(4), 678-680.

 

2021

1.    Cho, M.-S., Takayama, K., Yang, J., Maki, M., and Kim, S.-C. 2021. Genome-Wide Single Nucleotide Polymorphism Analysis Elucidates the Evolution of Prunus takesimensis in Ulleung Island: The Genetic Consequences of Anagenetic Speciation. Frontiers in Plant Science, 1835.

2.    Yang, J., Park, S., Gil, H.-Y., Pak, J. H., and Kim, S.-C. 2021. Characterization and dynamics of intracellular gene transfer in plastid genomes of Viola (Violaceae) and order Malpighiales. Frontiers in Plant Science, 12.

3.    Cho, M.-S., Kim, J. H., Yamada, T., Maki, M., and Kim, S.-C. 2021. Plastome characterization and comparative analyses of wild crabapples (Malus baccata and M. toringo): insights into infraspecific plastome variation and phylogenetic relationships. Tree Genetics & Genomes, 17(5): 1-16.

4.    Sun, E. M., Yun, S. A., Kim, S.-C., Chung, G.-Y., Nam, M.-J., and Im, H.-T. 2021. Saussurea albifolia MJ Nam & HT Im (Compositae), a new species from the Baekdudaegan Area, Korea. Journal of Species Research, 10(2): 159-163.

5.    Yun, S. A. and Kim, S.-C. 2021. Genetic diversity and structure of Saussurea polylepis (Asteraceae) on continental islands of Korea: Implications for conservation strategies and management. PloS one, 16(4): e0249752.

6.    Lee, W., Kim, Y. S., Kim, S.-C., and Pak, J. H. 2021. The complete chloroplast genome sequence of a narrow alpine endemic, Taraxacum hallaisanense (Asteraceae), on Jeju Island, Korea. Mitochondrial DNA Part B, 6(3): 1036-1038.

7.    Jeon, J.-H., Cho, M.-S., Yun, S. A., Gil, H.-Y., Kim, S.-H., Kwon, Y., Seo, H.-S., Shukhertei, A, and Kim, S.-C. 2021. Vascular plant diversity of Gwangdeoksan Mountain (Cheonan-Asan, Korea): insights into ecological and conservation importance. Korean Journal of Plant Taxonomy, 51(1): 49-99.

8.    Lee, J. S., Kim, S.-H., Kim, Y., Kwon, Y., Yang, J., Cho, M.-S., Kim, H.-B., Lee, S., Maki, M., and Kim, S.-C. 2021. Symplocarpus koreanus (Araceae; Orontioideae), a new species based on morphological and molecular data. Korean Journal of Plant Taxonomy, 51(1): 1-9.

9.    Lee, W., Yang, J., Kim, S.-C., and Pak, J. H. 2021. The complete chloroplast genome sequence of coastal psammophyte, Ixeris repens (Asteraceae, subtribe Crepidinae), in Korea. Mitochondrial DNA Part B, 6(3): 1050-1052.

10.  Lee, Y., Ni G., Shin, J., Kim T., Kern, E. M., Kim, Y., Kim, S.-C., Chan, B., Goto, R., Nakano, T., and Park, J.-K. 2021. Phylogeography of Mytilisepta virgata (Mytilidae: Bivalvia) in the northwestern Pacific: Cryptic mitochondrial lineages and mito-nuclear discordance. Molecular Phylogenetics and Evolution, 157: 107037.

11.  Yang, J., Chiang, Y. C., Hsu, T. W., Kim, S.-H., Pak, J.-H., and Kim, S.-C. 2021. Characterization and comparative analysis among plastome sequences of eight endemic Rubus (Rosaceae) species in Taiwan. Scientific Reports, 11(1): 1-12.

12.  Polezhaeva, M. A., Marchuk, E. A., Modorov, M. V., Ranyuk, M. N., Bondarchuk, S. N., Fukuda, T., Kim, S.-C., and Hojnowski, C. 2021. Insights into the genetic diversity and population structure of Rhododendron brachycarpum (Ericaceae) in East Asia as characterized by SSR markers. Plant Systematics and Evolution, 307(1): 1-13.

 

2020

1.    Cho, M-S., Kim, S-H., Yang, J., Crawford, D. J., Stuessy, T. F., López-Sepúlveda, P., and Kim, S.-C. 2020. Plastid phylogenomics of Dendroseris (Cichorieae; Asteraceae): Insights into structural organization and molecular evolution of an endemic lineage from the Juan Fernández Islands. Frontiers in Plant Science, 11.

2.    Yang, J., Takayama, K., Youn, J. S., Pak, J-H, and Kim, S.-C. 2020. Plastome Characterization and Phylogenomics of East Asian Beeches with a Special Emphasis on Fagus multinervis on Ulleung Island, Korea. Genes, 11(11): 1338.

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